沼气池管道的管径应按日产气量选定。为了减少沼气管道的压力损失，还应采用高峰产气量进行核算，高峰产气量约为平均产气量的1.5～3.0倍。沼气管道一般采用不锈钢管、防腐镀锌钢管或防腐碳钢管。沼气在管中流动时随着温度的逐渐降低，不断有冷凝水析出。为了排出冷凝水，输气管应以0.5％的坡降敷设，而且每隔一段距离或在最低处设置水封和排水口。

一般在沼气管道上的适当地点应设水封罐，以便调整和稳定压力，在消化池、储气柜、压缩机、锅炉房等构筑物之间起隔绝作用。水封罐也可兼作排除冷凝水之用，水封罐体截面积一般为进气管面积的4倍，水封高度为1.5倍气体压力。为了防止水封冻结，可采取加热、充装防冻溶液或连续供水等措施，也可置于室内。沼气中的H2S含量较高，输气管应采取防腐蚀措施。